Vous avez déjà un T1 en NIfTI (dé-identifié, ou issu d'un autre logiciel) et pas les DICOM d'origine. Le pipeline part directement de cette image.
Un seul argument change
On donne t1_path au lieu de dicom_dir. Exactement un des deux est requis — fournir les deux (ou aucun) lève une erreur immédiate.
result = reconstruct_sources(
subject="sample", output_dir="D:/derivatives",
t1_path="D:/anat/sample_T1w.nii.gz", # <- au lieu de dicom_dir
eeg_file="D:/eeg/sample.edf",
digitization="D:/dig/sample.elc",
simnibs_bin_dir="C:/Users/me/SimNIBS-4.5/bin",
events="find", event_id={"aud_l": 1},
)La conversion DICOM→NIfTI est simplement sautée ; le T1 est copié tel quel et alimente charm. Toutes les étapes suivantes sont identiques.
